Dr. Atsuko Chiba, a reserved research psychologist, uses her bubbly and adventurous dream-world alter-ego, Paprika , to illegally treat patients.
Di masa depan, sebuah alat revolusioner bernama "DC Mini" memungkinkan terapis untuk memasuki mimpi pasien mereka guna membantu mengobati gangguan mental. Namun, ketika alat tersebut dicuri, batas antara dunia nyata dan alam mimpi menjadi kabur, menyebabkan kekacauan massal. Dr. Atsuko Chiba, menggunakan persona terapinya di dunia mimpi bernama "Paprika", harus menyelamatkan kota sebelum kenyataan dan ilusi menyatu selamanya.
Paprika, seorang ilmuwan yang ceria dan berdedikasi, menggunakan alat ini untuk membantu pasien-pasien yang mengalami gangguan tidur dan mimpi buruk. Suatu hari, alat tersebut dicuri oleh seseorang yang tidak dikenal, dan Paprika harus memasuki dunia mimpi untuk mengambilnya kembali. Dalam petualangannya, dia bertemu dengan beberapa karakter yang menarik dan mengalami berbagai kejadian yang tidak terduga.
